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时间：2020-02-02 11:49
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| 序号 | 名称 | 拉丁学名 | 依据 |
| 一 | 双歧杆菌属 | Bifidobacterium | 可用于食品的菌种名单(卫办监督发〔2010〕65号) |
| 1 | 青春双歧杆菌 | Bifidobacterium adolescentis | |
| 2 | 动物双歧杆菌（乳双歧杆菌） |
Bifidobacterium animalis （Bifidobacterium lactis） |
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| 3 | 两歧双歧杆菌 | Bifidobacterium bifidum | |
| 4 | 短双歧杆菌 | Bifidobacterium breve | |
| 5 | 婴儿双歧杆菌 | Bifidobacterium infantis | |
| 6 | 长双歧杆菌 | Bifidobacterium longum | |
| 二 | 乳杆菌属 | Lactobacillus | 可用于食品的菌种名单(卫办监督发〔2010〕65号) |
| 1 | 嗜酸乳杆菌 | Lactobacillus acidophilus | |
| 2 | 干酪乳杆菌 | Lactobacillus casei | |
| 3 | 卷曲乳杆菌 | Lactobacillus crispatus | |
| 4 |
德氏乳杆菌保加利亚亚种 （保加利亚乳杆菌） |
Lactobacillus delbrueckii subsp. Bulgaricus （Lactobacillus bulgaricus） |
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| 5 | 德氏乳杆菌乳亚种 | Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis | |
| 6 | 发酵乳杆菌 | Lactobacillus fermentium | |
| 7 | 格氏乳杆菌 | Lactobacillus gasseri | |
| 8 | 瑞士乳杆菌 | Lactobacillus helveticus | |
| 9 | 约氏乳杆菌 | Lactobacillus johnsonii | |
| 10 | 副干酪乳杆菌 | Lactobacillus paracasei | |
| 11 | 植物乳杆菌 | Lactobacillus plantarum | |
| 12 | 罗伊氏乳杆菌 | Lactobacillus reuteri | |
| 13 | 鼠李糖乳杆菌 | Lactobacillus rhamnosus | |
| 14 | 唾液乳杆菌 | Lactobacillus salivarius | |
| 15 | 清酒乳杆菌 | Lactobacillus sakei | 关于批准番茄籽油等9种新食品原料的公告（2014年第20号） |
| 三 | 链球菌属 | Streptococcus | 可用于食品的菌种名单(卫办监督发〔2010〕65号) |
| 1 | 嗜热链球菌 | Streptococcus thermophilus | |
| 四 | 葡萄球菌属 | Staphylococcus | 关于小牛葡萄球菌等3菌种的公告(2016年第4号) |
| 1 | 小牛葡萄球菌 | Staphylococcus vitulinus | |
| 2 | 木糖葡萄球菌 | Staphylococcus xylosus | |
| 3 | 肉葡萄球菌 | Staphylococcus carnosus | |
| 五 | 芽孢杆菌属 | Bacillus | 关于发酵乳杆菌CECT5716等3个菌种的公告(2016年第6号) |
| 1 | 凝结芽孢杆菌 | Bacillus coagulans | |
| 六 | 乳球菌属 | Lactococcus | 关于批准翅果油等2种新资源食品的公告(2011年第1号) |
| 1 | 乳酸乳球菌乳酸亚种 | Lactococcuslactissubsp.lactis | |
| 2 | 乳酸乳球菌乳脂亚种 | Lactococcuslactissubsp.cremoris | |
| 3 | 乳酸乳球菌双乙酰亚种 | Lactococcus Lactis subsp. Diacetylactis | |
| 七 | 丙酸杆菌属 | Propionibacterium | 关于批准雨生红球藻等新资源食品的公告(卫生部第17号公告) |
| 1 | 费氏丙酸杆菌谢氏亚种 | Propionibacterium freudenreichii subsp. Shermanii | |
| 八 | 明串球菌属 | Leuconostoc | 关于将肠膜明串珠菌肠膜亚种列入《可用于食品的菌种名单》的公告(卫生部公告2012年第8号) |
| 1 | 肠膜明串珠菌肠膜亚种 | Leuconostoc mesenteroides subsp. Mesenteroides | |
| 九 | 丙酸杆菌属 | Propionibacterium | 关于批准番茄籽油等9种新食品原料的公告（2014年第20号） |
| 1 | 产丙酸丙酸杆菌 | Propionibacterium acidipropionici | |
| 十 | 片球菌属 | Pediococcus | 关于批准壳寡糖等6种新食品原料的公告（2014年第6号） |
| 1 | 乳酸片球菌 | Pediococcus acidilactici | |
| 2 | 戊糖片球菌 | Pediococcus pentosaceus | |
| 十一 | 克鲁维酵母属 | Kluyveromyces | 关于批准显齿蛇葡萄叶等3种新食品原料的公告（2013年第16号） |
| 1 | 马克斯克鲁维酵母 | Kluyveromyces marxianus | |
| 注：1.传统上用于食品生产加工的菌种允许继续使用。名单以外的、新菌种按照《新资源食品管理办法》执行。 | |||
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